Insieme alla proteina S la proteina C interviene nelle regolazione del processo di coagulazione.
In particolare la proteina C esercita un’attività coagulante grazie alla sua capacità di neutralizzare rapidamente l’attività del fattore V e VIII, mentre la “S” accelera l’inattivazione di questi fattori da parte della proteina C. Il dosaggio della proteina C plasmatica è utile in pazienti con ripetute tromboflebiti per confermare la presenza di un deficit congenito di questo fattore, la cui carenza configura un quadro di trombofilia.